Univerzita Pardubice je jednou z 26 veřejných vysokých škol ČR a má 7 fakult.
Fakultu chemicko-technologickou- FChT (založenou v roce 1950 jako VŠChT),
Fakultu ekonomicko-správní - FES (založenou v roce 1991),
Dopravní fakultu Jana Pernera - DFJP (založenou v roce 1993)
Fakultu filozofickou - FF (v roce 1992 založen Ústav cizích jazyků, později přejmenován na Ústav jazyků a humanitních studií, který byl přetransformován na samostatnou Fakultu humanitních studií v roce 2001, přejmenována v prosinci 2005 na Fakultu filozofickou),
Fakultu restaurování - FR (založenou v roce 2005),
Fakultu zdravotnických studií - FZS (v roce 2002 byl založen Ústav zdravotnických studií, který byl přetransformován na samostatnou Fakultu zdravotnických studií v lednu 2007),
Fakultu elektrotechniky a informatiky - FEI (založenou v roce 2002 jako Ústav informatiky, přejmenován v roce 2004 na Ústav elektrotechniky a informatiky, který byl přetransformován na samostatnou fakultu v lednu 2008),